答：根据个人所得税法规定，居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率。因此，如果纳税人存在两处以上工资薪金所得且都按照5000减除费用代扣代缴，在年度汇算时可能需要补税。为减轻纳税人办税负担，建议扣缴义务人与纳税人确认后，选择在一处扣除每月5000元的减除费用。