一、结论

堤围费和印花税都计入税金及附加，能够扣除，但是否能够单独扣除请看下文分析。

二、分析

（一）堤围费

土地增值税是一个地方性很强的税种，需要参照地方规定，堤围费根据穗地税函[2008]342号文第八条，关于房地产开发企业转让房地产时交纳的堤围防护费（1998年1月1日前为防洪工程维护费）视同为转让房地产有关的税金准予扣除，因此堤围费能够在税金及附加中单独扣除。

（二）印花税

1、根据《土地增值税暂行条例实施细则》第七条第五项规定，与转让房地产有关的税金，是指在转让房地产时缴纳的营业税、城市维护建设税、印花税，因此印花税可以扣除。

2、由于印花税过去在管理费用核算，根据《财政部国家税务总局关于土地增值税一些具体问题规定的通知》

（财税[1995]48号）第九条规定，关于计算增值额时扣除已缴纳印花税的问题，细则中规定允许扣除的印花税，是指在转让房地产时缴纳的印花税。房地产开发企业按照《施工、房地产开发企业财务制度》的有关规定，其缴纳的印花税列入管理费用，已相应予以扣除，印花税不能单独扣除。

3、2016年12月以后，根据《财政部关于印发<增值税会计处理规定>的通知》（财会[2016]22号)有关规定，全面试行营业税改征增值税后，“营业税金及附加”科目名称调整为“税金及附加”科目，该科目核算企业经营活动发生的消费税、城市维护建设税、资源税、教育费附加及房产税、土地使用税、车船使用税、印花税等相关税费，因此印花税已经计入税金及附加。

4、由于开发费用是按照（开发成本+土地成本）的一定比例扣除，和实际发生额没有关系，所以如果印花税能作为与转让房地产时缴纳的税金扣除的话，相当于可以多扣了。目前2016年版土地增值税申报表中用于房地产开发企业的，仍是不能填报印花税。

总之，印花税可以在土地清算时扣除，但目前能否单独扣除尚未明确，建议咨询当事税务机关。

三、政策依据

《土地增值税暂行条例实施细则》第七条第五项、《财政部国家税务总局关于土地增值税一些具体问题规定的通知》

财税[1995]48号)第九条、《财政部关于印发<增值税会计处理规定>的通知》（财会[2016]22号)

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